2004年11月，兰州大学“985工程”二期建设项目可行性研究报告通过教育部专家组论证审核，由教育部、财政部批准正式立项建设（教重函〔2004〕1号）。

2010年3月，兰州大学“985工程”二期通过国家验收。

主要建设任务

主要内容分为五个部分：管理体制与运行机制创新、队伍建设、科技创新平台和哲学社会科学创新基地建设、条件支撑、国际交流与合作。

◆ 管理体制与运行机制创新

建立以竞争、流动为核心的人事管理机制、人才评价机制和科学合理的分配激励机制，形成有利于优秀人才脱颖而出、吸引和稳定拔尖人才、充分发挥其聪明才智的氛围。

◆ 队伍建设

根据兰州大学队伍建设的实际和面临的特殊困难，在人才引进、智力引进工作中，进一步加大支持力度，不断创新和完善适合人才成长与发展的机制，努力形成培养造就大师级学者的氛围，为建设多学科协调发展的综合性、研究型、国际知名高水平大学提供有力的人才和师资队伍支持。力争在2010年前，使我校教学科研人员中具有研究生学历的比例达到90%左右，博士学位获得者的比例达到60%以上，师生比控制在1:16左右。建立一支结构更加合理、素质更加优良、具有更强竞争优势的师资队伍。

◆ 科技创新平台和哲学社会科学创新基地建设

兰州大学“985工程”二期科技创新平台共6个，其中Ⅰ类科技创新平台1个、Ⅱ类科技创新平台3个、部级科技创新平台2个，这6个平台分别是：西北资源环境与生态科技创新平台（Ⅰ类），功能有机分子化学科技创新平台（Ⅱ类），信息材料科技创新平台（Ⅱ类），草业工程科技创新平台（Ⅱ类），聚变中子、高电荷态物理学科技创新平台（部级）和西部地区科学计算与信息技术科技创新平台（部级）。

兰州大学“985工程”二期哲学社会科学创新基地共2个，分别是：西部经济社会发展哲学社会科学创新基地（Ⅰ类）和敦煌学哲学社会科学创新基地（Ⅰ类）。

◆ 条件支撑项目

兰州大学“985工程”二期条件支撑项目的建设子项目有两个：下一代互联网络（CERNET2）核心节点建设和图书馆（图书文献）建设。

◆ 国际交流与合作项目

加强国际交流与合作，缩短兰州大学与世界一流大学间的差距。